بنیاد حامیان دانشگاه الزهرا (س) در تاریخ 1397/09/30 با حضور اعضای هیئت موسس در راستای بهره گیری از توانمندی های مادی و معنوی خیّرین، تشویق و ترغیب توانگران و نیک اندیشان برای تقویت و گسترش زیر ساخت های دانشگاه الزهرا (س)، با همت جمعی از خیّرین نیک اندیش و دانش آموختگان نیک خواه دانشگاه الزهرا (س) به منظور حمایت از اهداف و مأموریت های ملی، منطقه ای و بین المللی دانشگاه راه اندازی شد.
اولین جلسه هیئت مؤسس بنیاد حامیان دانشگاه الزهرا (س) در همان سال پس از برگزاری چهارمین جشنواره خیّرین و واقفین دانشگاه الزهرا (س)، تشکیل شد. در همین سال امور مقدماتی و ثبت بنیاد آغاز شد. با توجه به اهمیت شروع فعالیت بنیاد در یک ساختمان مناسب، در پاییز 1397 دفتر کنونی بنیاد واقع در طبقه هفتم ساختمان خوارزمی توسط دانشگاه برای بهره برداری لازم در اختیار بنیاد قرار داده شد و از اسفند 1397 دفتر بنیاد در این ساختمان مستقر شد.